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双质粒系统中的pCas由cas9、λ-Red和sgRNA组成,sgRNA带有lacIq-Ptrc启动子,引导pMB1复制pTarget。通过引物扩增化脓性链球菌MGAS5005的cas9序列和天然启动子,然后连接到PstI/XbaI消化pSU2718得到pCB001。用引物pA006/pA007从pKD46K(21)中扩增出含有卡那霉素抗性基因kanR和温度敏感复制子repA101(Ts)的kanR-repA101片段,用pA008/pA009从pTrc99A中扩增出lacIq基因和Ptrc启动子(lacIq-Ptrc片段),用pA010/pA011从pTarget中扩增出sgRNA-pMB1序列,。通过pA012/pA013从pKD46中扩增出Red重组酶基因,并用XbaI消化。pCas是通过将cas9盒与kanR-repA101的PstI/BglII消化的重叠PCR产物、lacIq-Ptrc片段和XbaI/BglII酶切的Red基因连接而构建的。通过将MluI/XhoI消化的pTrc99A框架与由pIJ778的pA054/pA055扩增的大观霉素抗性基因aadA连接,构建了pTrc99A-specpTargetF系列用于靶向单基因修饰,具有靶向N20序列的感兴趣基因位点,是通过反向PCR获得的,修饰的N20序列挂在引物的5=末端,然后进行自连接。

图片46.png

参考文献:Jiang Y, Chen B, Duan C, Sun B, Yang J, Yang S. Multigene editing in the Escherichia coli genome via the CRISPR-Cas9 system. Appl Environ Microbiol. 2015 Apr;81(7):2506-14. doi: 10.1128/AEM.04023-14. Epub 2015 Jan 30. Erratum in: Appl Environ Microbiol. 2016 May 31;82(12):3693.

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通过CRISPR-Cas9系统对大肠杆菌基因组进行多基因编辑

双质粒系统中的pCas由cas9、λ-Red和sgRNA组成,sgRNA带有lacIq-Ptrc启动子,引导pMB1复制pTarget。通过引物扩增化脓性链球菌MGAS5005的cas9序列和天然启动子,然后连接到PstI/XbaI消化pSU2718得到pCB001。用引物pA006/pA007从pKD46K(21)中扩增出含有卡那霉素抗性基因kanR和温度敏感复制子repA101(Ts)的kanR-repA101片段,用pA008/pA009从pTrc99A中扩增出lacIq基因和Ptrc启动子(lacIq-Ptrc片段),用pA010/pA011从pTarget中扩增出sgRNA-pMB1序列,。通过pA012/pA013从pKD46中扩增出Red重组酶基因,并用XbaI消化。pCas是通过将cas9盒与kanR-repA101的PstI/BglII消化的重叠PCR产物、lacIq-Ptrc片段和XbaI/BglII酶切的Red基因连接而构建的。通过将MluI/XhoI消化的pTrc99A框架与由pIJ778的pA054/pA055扩增的大观霉素抗性基因aadA连接,构建了pTrc99A-specpTargetF系列用于靶向单基因修饰,具有靶向N20序列的感兴趣基因位点,是通过反向PCR获得的,修饰的N20序列挂在引物的5=末端,然后进行自连接。

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参考文献:Jiang Y, Chen B, Duan C, Sun B, Yang J, Yang S. Multigene editing in the Escherichia coli genome via the CRISPR-Cas9 system. Appl Environ Microbiol. 2015 Apr;81(7):2506-14. doi: 10.1128/AEM.04023-14. Epub 2015 Jan 30. Erratum in: Appl Environ Microbiol. 2016 May 31;82(12):3693.

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