1、好氧菌：在有氧环境中生长繁殖，氧化有机物或无机物的产能代谢过程，以分子氧为最终电子受体，进行有氧呼吸。包括大多数细菌、放线菌和真菌。

  2、微好氧菌：仅能在较低氧分压下正常生活的微生物。正常大气的氧分压为0.2Pa，而微好氧菌仅生活在0.01～0.03Pa下。例如发酵单胞菌属和弯曲杆菌属等。

  3、耐氧厌氧菌：代表菌种为溶组织梭菌。这类细菌不能利用氧，在无氧条件下生长好，而在有氧条件下生长不佳。如：破伤风芽胞杆菌。    

  4、专性厌氧菌：只能在没有游离氧存在的环境中生存的微生物。此类细菌缺乏完善的呼吸酶系统，只能进行无氧发酵，不但不能利用分子氧，而且游离氧对其还有毒性作用。如破伤风杆菌、肉毒杆菌、产生荚膜杆菌等。

  5、兼性厌氧菌：在有氧或无氧环境中均能生长繁殖的微生物。在有氧或缺氧条件下，可通过不同的氧化方式获得能量。如酵母菌在有氧环境中进行有氧呼吸，在缺氧条件下发酵葡萄糖生成酒精。