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首先使用引物pCN_AMP_mut_F和pCN_AMP_mut_R的定点诱变消除pCN50的BSAI限制性位点,以产生载体pCN50-BSAI。重组酶在组成型P23启动子的控制下合成为gBlocks,并针对金黄色葡萄球菌进行密码子优化。gBlocks用XmaI和NarI消化,并克隆到类似消化的pCN50-BSAI中,得到载体pCN50-EF2132、pCN50-gp20、pCN50-2recTS2、pCN50-recTS3和pCN50-bet。为了产生载体pCN-EF2132tet,在P23启动子的控制下合成金黄色葡萄球菌密码子优化的tetR盒作为gBlock,然后用引物扩增,Gibson组装XhoI消化的pCN50-EF2132。为了构建载体pCAS9counter,通过使用引物从载体pCN33扩增ermC,并克隆到ApaI和XhoI-pCN50-BSAI限制性位点,将pCN50-BSSI的氯霉素抗性盒替换为红霉素抗性盒,以产生质粒pCN50-BS1I-emrc。用引物扩增pCL52.2pCN50-BSAI-emc,gibson将产物组装成载体pCN50-ermc E194ts,用引物进行定点突变,在pCAS9中的Cas9末端引入最小SsrA标签,然后从载体pCAS9扩增Cas9,使用引物将其置于PRAB17启动子的控制下,然后克隆到用XmaI和SbfI消化的pCN50-ermc-E194ts中,得到pCN50-termc-Cas9。在PRAB17启动子和下游转录终止子的控制下合成的sgRNA被合成为gBlock,并克隆到pCN50-ermc-Cas9的NarI位点,以产生载体pCAS9counter。

图片3.png

参考文献:Penewit K, Holmes EA, McLean K, Ren M, Waalkes A, Salipante SJ. Efficient and Scalable Precision Genome Editing in Staphylococcus aureus through Conditional Recombineering and CRISPR/Cas9-Mediated Counterselection. mBio. 2018 Feb 20;9(1):e00067-18.

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CRISPR/Cas9介导的反选择在金黄色葡萄球菌中进行高效和可扩展的精确基因组编辑

首先使用引物pCN_AMP_mut_F和pCN_AMP_mut_R的定点诱变消除pCN50的BSAI限制性位点,以产生载体pCN50-BSAI。重组酶在组成型P23启动子的控制下合成为gBlocks,并针对金黄色葡萄球菌进行密码子优化。gBlocks用XmaI和NarI消化,并克隆到类似消化的pCN50-BSAI中,得到载体pCN50-EF2132、pCN50-gp20、pCN50-2recTS2、pCN50-recTS3和pCN50-bet。为了产生载体pCN-EF2132tet,在P23启动子的控制下合成金黄色葡萄球菌密码子优化的tetR盒作为gBlock,然后用引物扩增,Gibson组装XhoI消化的pCN50-EF2132。为了构建载体pCAS9counter,通过使用引物从载体pCN33扩增ermC,并克隆到ApaI和XhoI-pCN50-BSAI限制性位点,将pCN50-BSSI的氯霉素抗性盒替换为红霉素抗性盒,以产生质粒pCN50-BS1I-emrc。用引物扩增pCL52.2pCN50-BSAI-emc,gibson将产物组装成载体pCN50-ermc E194ts,用引物进行定点突变,在pCAS9中的Cas9末端引入最小SsrA标签,然后从载体pCAS9扩增Cas9,使用引物将其置于PRAB17启动子的控制下,然后克隆到用XmaI和SbfI消化的pCN50-ermc-E194ts中,得到pCN50-termc-Cas9。在PRAB17启动子和下游转录终止子的控制下合成的sgRNA被合成为gBlock,并克隆到pCN50-ermc-Cas9的NarI位点,以产生载体pCAS9counter。

图片3.png

参考文献:Penewit K, Holmes EA, McLean K, Ren M, Waalkes A, Salipante SJ. Efficient and Scalable Precision Genome Editing in Staphylococcus aureus through Conditional Recombineering and CRISPR/Cas9-Mediated Counterselection. mBio. 2018 Feb 20;9(1):e00067-18.

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