先分别比对，掐头去尾。然后可以使用excel合并，注意同一菌株的串联（有个软件叫phylosuite也可以）。之后可以当做一个序列建树。当然最好指定每个基因起始位置，对每个基因选择最优模型后建ML树或贝叶斯树。NJ或MP树对远缘序列容易出问题
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