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使用KOD-Plus-mu-tagenesis试剂盒构建获得ade6-1450区域的cas9表达质粒tar。pMZ374用作引物对F-ade6-1450+R-ade6-1450的模板。所得质粒命名为pMZ374-ade6。用引物通过PCR分别扩增上游和下游区域。扩增片段通过重叠延伸PCR与引物对结合。使用pDUAL-HFG31(RIKEN BRC)作为模板,使用引物通过PCR扩增gfp表达盒。用引物对分别扩增上游和下游区域。通过重叠延伸PCR将三个扩增片段与引物偶联,产生HR供体DNA,用于引入盒的染色体ade6位点,在cam1启动子的控制下指导gfp的表达。为了构建d-ldh表达盒,使用细菌基因组DNA通过PCR扩增植物乳杆菌NCIMB 8826的d-ldh编码基因。将PCR产物克隆到pDUAL-FFH61的NheI和SalI位点,所得质粒命名为pDUAL-FF H61-dLDH。然后通过PCR扩增d-ldh表达盒。用引物对分别扩增上游和下游区域。通过重叠延伸PCR将三个扩增片段与引物偶联,得到HR供体DNA,用于引入d-ldh表达盒的染色体gut2区域。使用引物对类似地构建了用于引入d-ldh表达盒染色体adh8区域的HR供体DNA。为了构建bgl(β-葡萄糖苷酶)表达盒,将来自粟酒酵母的hsp90启动子与引物对拼接。将拼接片段克隆在pDUAL-FFH61的SpeI和SacI位点之间。接下来,扩增来自粟酒链球菌的nmt1终止子。将扩增片段克隆在上述质粒的XhoI和NotI位点之间,所得质粒命名为pDUAL-hsp。然后,使用pDUAL SPBC359.04c_BGL作为模板,用引物扩增编码与锚定蛋白SPBC359.084c融合的尖曲霉β-葡萄糖苷酶的基因。扩增片段克隆在pDUAL-hsp的XhoI和NotI位点之间;所得质粒命名为pDUAL-hsp-SPBC359.04c_BGL。使用该质粒作为模板,使用引物对通过PCR产生三个片段。扩增的片段通过重叠延伸PCR与引物偶联,产生HR供体DNA,用于引入bgl表达盒的染色体gut2区域。

图片26.png

参考文献:Ozaki A, Konishi R, Otomo C, Kishida M, Takayama S, Matsumoto T, Tanaka T, Kondo A. Metabolic engineering of Schizosaccharomyces pombe via CRISPR-Cas9 genome editing for lactic acid production from glucose and cellobiose. Metab Eng Commun. 2017 Aug 24;5:60-67.

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利用CRISPR-Cas9基因组编辑乳糖和葡萄糖生产裂殖酵母的代谢工程

使用KOD-Plus-mu-tagenesis试剂盒构建获得ade6-1450区域的cas9表达质粒tar。pMZ374用作引物对F-ade6-1450+R-ade6-1450的模板。所得质粒命名为pMZ374-ade6。用引物通过PCR分别扩增上游和下游区域。扩增片段通过重叠延伸PCR与引物对结合。使用pDUAL-HFG31(RIKEN BRC)作为模板,使用引物通过PCR扩增gfp表达盒。用引物对分别扩增上游和下游区域。通过重叠延伸PCR将三个扩增片段与引物偶联,产生HR供体DNA,用于引入盒的染色体ade6位点,在cam1启动子的控制下指导gfp的表达。为了构建d-ldh表达盒,使用细菌基因组DNA通过PCR扩增植物乳杆菌NCIMB 8826的d-ldh编码基因。将PCR产物克隆到pDUAL-FFH61的NheI和SalI位点,所得质粒命名为pDUAL-FF H61-dLDH。然后通过PCR扩增d-ldh表达盒。用引物对分别扩增上游和下游区域。通过重叠延伸PCR将三个扩增片段与引物偶联,得到HR供体DNA,用于引入d-ldh表达盒的染色体gut2区域。使用引物对类似地构建了用于引入d-ldh表达盒染色体adh8区域的HR供体DNA。为了构建bgl(β-葡萄糖苷酶)表达盒,将来自粟酒酵母的hsp90启动子与引物对拼接。将拼接片段克隆在pDUAL-FFH61的SpeI和SacI位点之间。接下来,扩增来自粟酒链球菌的nmt1终止子。将扩增片段克隆在上述质粒的XhoI和NotI位点之间,所得质粒命名为pDUAL-hsp。然后,使用pDUAL SPBC359.04c_BGL作为模板,用引物扩增编码与锚定蛋白SPBC359.084c融合的尖曲霉β-葡萄糖苷酶的基因。扩增片段克隆在pDUAL-hsp的XhoI和NotI位点之间;所得质粒命名为pDUAL-hsp-SPBC359.04c_BGL。使用该质粒作为模板,使用引物对通过PCR产生三个片段。扩增的片段通过重叠延伸PCR与引物偶联,产生HR供体DNA,用于引入bgl表达盒的染色体gut2区域。

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参考文献:Ozaki A, Konishi R, Otomo C, Kishida M, Takayama S, Matsumoto T, Tanaka T, Kondo A. Metabolic engineering of Schizosaccharomyces pombe via CRISPR-Cas9 genome editing for lactic acid production from glucose and cellobiose. Metab Eng Commun. 2017 Aug 24;5:60-67.

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