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对于pta缺失,分别使用引物d-pta-FU/L和d-pta-BU/L从枯草芽孢杆菌基因组中扩增其上下游片段,通过融合PCR将这两个片段融合并扩增。然后用SphI-KpnI消化融合片段(pta FB),并将其连接到pCU的相同消化位点以产生pCU-ptaFB。

用相应的ldh缺失引物扩增ldhFB融合片段。用AatII消化,将片段连接到pCU的相应位点,得到质粒pCU-ldhFB。对于无标记基因过表达,通过pPSDBUE的引物O-P43-U和O-alsSD-L对枯草芽孢杆菌强启动子P43和alsS和alsD基因片段一起进行扩增,然后放置在pCU-bdhAFB中bdhA的上游和下游片段之间,产生pCU-bdh-A-PSD,用于枯草芽孢杆菌基因组中alsSD的过表达。用引物从枯草芽孢杆菌染色体DNA中扩增出P43启动子,用BamHI-SmaI消化,并连接到pUC18的匹配位点,得到pUC18-P43。然后用引物将alsS和alsD基因一起扩增,用SmaI-BamHI消化,并连接到用相同酶消化的pUC18-P43上,形成pUC18-P43-SD。接下来,用引物扩增udhA基因,用XbaI-SalI消化,连接到pUC18-P4 3-SD的相同位点,形成pUC18-P43-SDU。随后,用BamHI消化引物扩增的budC基因,并将其连接到用相同限制性内切酶切位点消化的pUC18-P43-SDU上,得到pUC18-P43-SDBU。最后,用引物从pHP13中扩增红霉素抗性基因erm,并将其连接到AatII消化的pUC18-P43-SDBU上,得到pPSDBUE。用引物从肺炎克雷伯菌CICC10011中通过PCR扩增budC。这些片段用限制性内切酶KpnI-BamHI消化,并连接到KpnI-BanHI消化的pHP13-P43上,得到pHP13-P43-budC。用引物S-budC U/L扩增budC基因,用BamHI-XbaI消化,并将其连接到pUC18-SP的匹配位点上,形成pUC18-SP-budC。

图片85.png

参考文献:Fu J, Huo G, Feng L, Mao Y, Wang Z, Ma H, Chen T, Zhao X. Metabolic engineering of Bacillus subtilis for chiral pure meso-2,3-butanediol production. Biotechnol Biofuels. 2016 Apr 19;9:90.

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枯草芽孢杆菌2、3-丁二醇生产的代谢工程

对于pta缺失,分别使用引物d-pta-FU/L和d-pta-BU/L从枯草芽孢杆菌基因组中扩增其上下游片段,通过融合PCR将这两个片段融合并扩增。然后用SphI-KpnI消化融合片段(pta FB),并将其连接到pCU的相同消化位点以产生pCU-ptaFB。

用相应的ldh缺失引物扩增ldhFB融合片段。用AatII消化,将片段连接到pCU的相应位点,得到质粒pCU-ldhFB。对于无标记基因过表达,通过pPSDBUE的引物O-P43-U和O-alsSD-L对枯草芽孢杆菌强启动子P43和alsS和alsD基因片段一起进行扩增,然后放置在pCU-bdhAFB中bdhA的上游和下游片段之间,产生pCU-bdh-A-PSD,用于枯草芽孢杆菌基因组中alsSD的过表达。用引物从枯草芽孢杆菌染色体DNA中扩增出P43启动子,用BamHI-SmaI消化,并连接到pUC18的匹配位点,得到pUC18-P43。然后用引物将alsS和alsD基因一起扩增,用SmaI-BamHI消化,并连接到用相同酶消化的pUC18-P43上,形成pUC18-P43-SD。接下来,用引物扩增udhA基因,用XbaI-SalI消化,连接到pUC18-P4 3-SD的相同位点,形成pUC18-P43-SDU。随后,用BamHI消化引物扩增的budC基因,并将其连接到用相同限制性内切酶切位点消化的pUC18-P43-SDU上,得到pUC18-P43-SDBU。最后,用引物从pHP13中扩增红霉素抗性基因erm,并将其连接到AatII消化的pUC18-P43-SDBU上,得到pPSDBUE。用引物从肺炎克雷伯菌CICC10011中通过PCR扩增budC。这些片段用限制性内切酶KpnI-BamHI消化,并连接到KpnI-BanHI消化的pHP13-P43上,得到pHP13-P43-budC。用引物S-budC U/L扩增budC基因,用BamHI-XbaI消化,并将其连接到pUC18-SP的匹配位点上,形成pUC18-SP-budC。

图片85.png

参考文献:Fu J, Huo G, Feng L, Mao Y, Wang Z, Ma H, Chen T, Zhao X. Metabolic engineering of Bacillus subtilis for chiral pure meso-2,3-butanediol production. Biotechnol Biofuels. 2016 Apr 19;9:90.

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