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1.pUC19中扩增出片段1,包含氨苄青霉素抗性基因(bla)和复制区(pBR322-ori),两侧与片段2有相应的同源性。同时,从质粒pMA09中扩增出片段2,片段2携带复制蛋白(Rep)、卡那霉素抗性基因(neor)和博莱霉素抗性基因(ble),片段2两侧有片段1的相应同源性。1:2的摩尔比混合然后T4 DNA聚合酶处理处理2.5分钟,接着将混合物在冰上孵育10分钟,使两个碎片退火,然后将混合物转化大肠杆菌JM109感受态细胞。将得到的质粒命名为pBSG01

2.使用引物从B.sub-tilis 168的染色体上扩增出0.6-kbPsrfA,其两侧在pBSG01插入位置的上游和下游有30 bp的同源序列。然后使用引物反向PCR将质粒pBSG01线性化。将两个碎片连接起来所得质粒命名为pBSG02

3.pBS1154扩增GFP基因,侧翼包含与插入位置的上游和下游序列相对应的30 bp同源序列。同时,用引物通过反向PCRpBSG02线性化。这两个片段进行连接,产生质粒pBSG03。以pBSG03为模板,通过反向PCR,用引物构建了携带工程化PsrfA的质粒pBSG05

4.以质粒pMA05为模板,用引物扩增AP,用引物线性化pBSG02。通过以与pBSG02相同的方式处理这两个片段获得了pBSG06。所有质粒构建体都通过DNA测序进行了验证。

如前所述,对枯草芽孢杆菌168染色体上的基因进行了无标记缺失,并进行了一些修改。

5.从枯草芽孢菌基因组中扩增出两个片段。具体流程如下。用引物扩增了由PsrfA上游约1kb同源片段、枯草芽孢杆菌dif位点和zeo基因5′端6-bp同源区组成的向上序列。同样,用引物扩增了下行序列,该序列由zeo基因3′端的5-bp同源片段枯草芽孢杆菌dif位点和PsrfA基因下游的约1kb同源片段组成。接下来,使用引物从质粒p7Z6中扩增出抗性基因zeo,其侧翼含有与染色体同源5-bp序列5'末端存在着两侧有5-bp染色体同源序列的dif序列。这三个片段通过融合PCR组装。然后对得到的2.5kb片段进行测序,并将其转化到枯草芽孢杆菌168感受态细胞中。PsrfA缺失的阳性突变株命名为BSG1681(枯草芽孢杆菌168:ΔPsrfA)。

Fig. 1

参考文献:Guan C, Cui W, Cheng J, Zhou L, Guo J, Hu X, Xiao G, Zhou Z. Construction and development of an auto-regulatory gene expression system in Bacillus subtilis. Microb Cell Fact. 2015 Sep 21;14:150. doi: 10.1186/s12934-015-0341-2. PMID: 26392346; PMCID: PMC4578258.

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枯草芽孢杆菌结合细胞密度的自调节表达系统构建

1.pUC19中扩增出片段1,包含氨苄青霉素抗性基因(bla)和复制区(pBR322-ori),两侧与片段2有相应的同源性。同时,从质粒pMA09中扩增出片段2,片段2携带复制蛋白(Rep)、卡那霉素抗性基因(neor)和博莱霉素抗性基因(ble),片段2两侧有片段1的相应同源性。1:2的摩尔比混合然后T4 DNA聚合酶处理处理2.5分钟,接着将混合物在冰上孵育10分钟,使两个碎片退火,然后将混合物转化大肠杆菌JM109感受态细胞。将得到的质粒命名为pBSG01

2.使用引物从B.sub-tilis 168的染色体上扩增出0.6-kbPsrfA,其两侧在pBSG01插入位置的上游和下游有30 bp的同源序列。然后使用引物反向PCR将质粒pBSG01线性化。将两个碎片连接起来所得质粒命名为pBSG02

3.pBS1154扩增GFP基因,侧翼包含与插入位置的上游和下游序列相对应的30 bp同源序列。同时,用引物通过反向PCRpBSG02线性化。这两个片段进行连接,产生质粒pBSG03。以pBSG03为模板,通过反向PCR,用引物构建了携带工程化PsrfA的质粒pBSG05

4.以质粒pMA05为模板,用引物扩增AP,用引物线性化pBSG02。通过以与pBSG02相同的方式处理这两个片段获得了pBSG06。所有质粒构建体都通过DNA测序进行了验证。

如前所述,对枯草芽孢杆菌168染色体上的基因进行了无标记缺失,并进行了一些修改。

5.从枯草芽孢菌基因组中扩增出两个片段。具体流程如下。用引物扩增了由PsrfA上游约1kb同源片段、枯草芽孢杆菌dif位点和zeo基因5′端6-bp同源区组成的向上序列。同样,用引物扩增了下行序列,该序列由zeo基因3′端的5-bp同源片段枯草芽孢杆菌dif位点和PsrfA基因下游的约1kb同源片段组成。接下来,使用引物从质粒p7Z6中扩增出抗性基因zeo,其侧翼含有与染色体同源5-bp序列5'末端存在着两侧有5-bp染色体同源序列的dif序列。这三个片段通过融合PCR组装。然后对得到的2.5kb片段进行测序,并将其转化到枯草芽孢杆菌168感受态细胞中。PsrfA缺失的阳性突变株命名为BSG1681(枯草芽孢杆菌168:ΔPsrfA)。

Fig. 1

参考文献:Guan C, Cui W, Cheng J, Zhou L, Guo J, Hu X, Xiao G, Zhou Z. Construction and development of an auto-regulatory gene expression system in Bacillus subtilis. Microb Cell Fact. 2015 Sep 21;14:150. doi: 10.1186/s12934-015-0341-2. PMID: 26392346; PMCID: PMC4578258.

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