苯酚/氯仿作为蛋白变性剂,同时抑制了DNase的降解作用。用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与DNA联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。蛋白分子溶于酚相,而DNA溶于水相。离心分层后取出水层,多次重复操作,再合并含DNA的水相,利用核酸不溶于醇的性质,用乙醇沉淀DNA。此法的特点是使提取的DNA保持天然状态,真核细胞DNA的分离通常是在EDTA及SDS一类去污剂存在下,用蛋白酶K消化细胞获得。
1.实验操作步骤
(1)1ml菌体发酵液,离心10min,去上清液;
(2)加500uLTE悬浮沉淀,并加10-20uLLysozyme混匀,37度保温0.5h;
(3)加30uL10%SDS,3uL20ug/ml(或1mg干粉)蛋白酶K,混匀,37度保温1h;
4)加100ul5mol/LNaCl混匀;
(5)加8ulCTAB/NaCl溶液,混匀,65度保温10min;
(6)用等体积酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)抽提,离心5min,将上清液移至干净离心管中;
(7)用等体积氯仿:异戊醇(24:1)抽提,离心5min,取上清液移至干净离心管中;
(8)加等体积异丙醇,颠倒混合,-20度静止20min,沉淀DNA,离心5min;
(9)倒出上清液,DNA沉淀用70%乙醇漂洗后,吸干,溶解于50uLTE;
(10)最后贮存液中加入1uLRNase。
2.实验结果
通常可获得3-5ugDNA。
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