耐药跟毒力之间的关系，并不能单一的说耐药菌株毒力高或者是耐药菌株毒力低，其实这两种表型都是有相关报道的，只是大家对第一种的报道更多，关注度更高而已。这两种表型都是合理的，都是可以解释的，原因是耐药跟毒力并不是因果关系，它们之间只是一种线性关系，而将这两者联系起来的，是更重要的宿主，所以不管是正相关还是负相关，都是可以解释的。不如第一种，耐药菌株毒力高，我们可以这样理解，对于条件致病性细菌来说，即使是强毒株，在宿主正常的情况下，也不能够引起宿主发病，而一但宿主发病了，那么发病的宿主就更容易接触到高浓度的抗生素（原因：细菌治疗主要还是靠抗生素），那么对于这种细菌来说，高耐药的菌株，毒力强就很容易理解了（原因：细菌耐药产生的前提是必须与药物接触，存在选择压力）。那么对于耐药菌株毒力低的说法，我们可以这样理解，对于强致病性的菌株，特别是急性致死性的菌株来说，一旦发病，宿主大多死亡，即使存活下来，一般也会被淘汰（家畜类）（人源致病菌的话，这种细菌大多数要么使人死亡，要么被清除），那么相对弱毒的菌株，就会在得到高耐药的情况下，更容易存活，进而进化。
结论：细菌的耐药性和毒力之间存在的只是线性关系，而不是因果关系，这种关系只是细菌在宿主体内进化的一种表象。