将保藏状态的菌种放入适宜的培养基中培养，逐级扩大培养得到纯而壮的培养物，即获得活力旺盛的、接种数量足够的培养物。菌种发酵有一般需要2-3代的复壮过程，因为保存时的条件往往和培养时的条件不相同，所以要活化，让菌种逐渐适应培养环境。菌种经过冷冻干燥后，生长延迟期较长，需连续两次继代培养才能正常生长。

将菌种接种至一新鲜培养基上，每萌发一次即为一代，因此，当原始菌种复溶并转至新培养基内生长，即认为已传代一次，从菌种保藏中心获得的冷冻干燥的菌种为第0代，冷冻干燥的原始菌种开启后转种为第1代，直到第3代为工作菌种。菌种的传代次数（自原始菌种冻干粉起）不得超过5代。直接从冻存摇的菌甘油放了不少可能会抑制菌的生长，活力差，而且多余的甘油对细菌生长不利，经划板的菌株活力好，可以挑菌摇菌提质粒或者做表达用。

微生物试验培养放大一般强调单一菌落来源，这样是为了保证样品的均一性。所以先挑1个单菌落于50ml的液体培养基中小锥形瓶中，然后将这1瓶中的分到4个200ml的大锥形瓶中继续扩大培养。