一、gutMDisorder数据库

gutMDisorder数据库链接：http://bio-annotation.cn/gutMDisorder/，由哈尔滨医科大学研究人员开发，旨在为肠道菌群与疾病/干预之间的关系提供综合数据资源，均经过16S扩增子测序、宏基因组测序或qPCR验证。gutMDisorder目前收录了人类579种肠道微生物，与123种疾病和77种干预措施之间共2263种关联；小鼠273种肠道微生物，与33种疾病和151种干预措施之间共930种关联。

1.Browse

左侧树状浏览器分了人和小鼠两个大类，每个物种分为肠道微生物群、失调（关联的疾病）、干预三个亚类。

以失调（关联的疾病）为例，选择疾病“2型糖尿病”，2型糖尿病和肠道微生物之间的所有关联都显示在右侧表格中，也可以下载到本地查看。第5列就是2型糖尿病相关的菌群，分类层级，上/下调以及所用测序手段，单击每一行的“detail”链接可以查看关联的详细信息。

2.Search

输入微生物、失调（关联的疾病）、干预关键词，通过搜索引擎查询关联信息。

同样以“2型糖尿病”为例，在搜索框中输入“type 2 diabetes mellitus”，数据库中与2型糖尿病相关联的信息展示在右侧（可以下载到本地），单击每一行的“detail”链接可以查看关联的详细信息。

3.Resources

可以在“Resource”页面下载所有数据库内容。

4.Submit

可以点击“Submit”提交数据库中未收录的关联信息。一旦评审委员会批准，包含详细信息的关联将包含在更新版本的数据库中。

二、GMrepo数据库

GMrepo数据库链接：https://gmrepo.humangut.info，由华中科技大学生命科学与技术学院陈卫华教授开发，数据库收录包含92个表型的 57784个人类肠道样本，包括精神疾病、癌症、炎症免疫疾病等，涵盖了大多数疾病类别。

1.Phenotypes

点击表型“Phenotypes”，同样以2型糖尿病为例，输入“Diabetes Mellitus, Type 2”，点击疾病链接，可以得到2型糖尿病相关的物种，属以及样本信息。

点击物种链接，进入该疾病中物种的详细信息。

Statistics数据统计信息：横坐标是相对丰度，纵坐标是样本百分比，红色代表疾病人群样本，绿色代表健康人群样本。

下面是与该物种共出现的其他物种信息：

点击物种后的小箭头，可以查看该物种相关的其他疾病信息，每一行代表相关的疾病，横坐标代表样本占比。

2.Species

点击Species，可以输入关注的菌群搜索。

3.Data

可以在“Data”页面下载所有数据库内容。

参考文献

1.Cheng L, Qi C, Zhuang H, et al. gutMDisorder: a comprehensive database for dysbiosis of the gut microbiota in disorders and interventions. Nucleic Acids Research, 2020.

2.Wu S, Sun C, Li Y, et al. GMrepo: a database of curated and consistently annotated human gut metagenomes. Nucleic Acids Res. 2019.