侵袭性真菌感染的微生物学检查包括：①临床标本直接镜检；②真菌培养；③非培养检测，包括组织学方法、血清学方法和分子生物学方法，其中以血清学方法应用广泛。血清学方法有1，3-β-D葡聚糖试验（G试验）、半乳甘露聚糖抗原检测（GM试验）等。

定植可以是真菌和宿主之间建立长期持续的共生关系或者是无害关系的最后一步，其可转化为真菌感染和疾病发生、发展的第一步。共生或致病取决于宿主和微生物的特征，但均依赖于真菌首先成功定植在宿主组织表面。

将标本或培养物直接涂片，固定后用标记荧光素的流感嗜血杆菌抗血清染色，30分钟后，洗去多余血清，用荧光显微镜检查。此法可迅速得出结果，为早期诊断的重要方法。

传统方法是根据糖类的降解反应及硝酸盐还原试验，此法需要大量细菌，耗时长，且易出现假阳性。近年来不断推出快速、准确、简易的方法，如改良糖类降解试验、产色底物快速酶试验、丁酸盐油脂水解试验、丁酸酯酶试验等。其中：Bacto-TB水解试验具有特异、实用、简单、费用低等优点，可对MC作出快速鉴定。基于LPS的血清学分型、β-内酰胺酶蛋白等电聚焦、蛋白外膜电泳谱均已用于MC的表现型鉴定。最近基于核酸多态性的限制酶分析、巨限酶（macrorestriction enzyme）和脉冲场凝胶电泳（PFGE）技术也为细菌学检测提供了有力武器。菌株特异性DNA探针也已试用于临床。片段长度多...

MUCICAT system contains 4 plasmids: pDonor, pTnsABC, pQCascade and pCutamp.

一般来讲，有qPCR法，也有直接用illumina/454测序来定量分析的。方法就是找到16srDNA的保守区设计引物，PCR后进行测序。若qPCR，则需要引物能够区分出那几种细菌，即引物不能设计在保守区。还是测序来得方便。对于总DNA的提取，也很关键。尽量做到全面，不要损失太多。DNA不能区分死菌和活菌；RNA可以。但是RNA操作起来麻烦，中间误差也大，不一定哪个好。